Peppol en Belgique : quel logiciel de facturation choisir en 2026 ?

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Depuis ce début d’année (2026), la facturation électronique via Peppol est obligatoire pour tous les indépendants belges soumis à la TVA qui facturent à d’autres entreprises (B2B). Vous utilisez peut-être déjà un outil, mais vous vous demandez s’il s’agit du bon choix. Ou peut-être êtes-vous un nouvel indépendant à la recherche de la meilleure option pour votre entreprise.

Dans cet article, nous allons comparer les logiciels de facturation électronique les plus utilisés pour Peppol en Belgique en fonction de ce qui compte vraiment pour les indépendants et les petites entreprises : le prix, la simplicité d’emploi et les fonctionnalités.

Quels critères pour choisir un logiciel adapté à Peppol ?

Lorsqu’il est question de choisir le meilleur logiciel de facturation électronique pour votre entreprise, il n’y a pas de solution universelle. Voilà pourquoi nous vous recommandons de vous poser ces 3 questions avant de faire un choix :

1. Le logiciel inclut-il l’enregistrement sur Peppol ?

Pour pouvoir envoyer et recevoir des factures électroniques, vous devez vous enregistrer sur le réseau Peppol. Il s’agit d’une procédure à réaliser une fois. Choisissez de préférence un outil qui propose cet enregistrement gratuitement.

Faites également attention à la façon dont se passe l’enregistrement. Les meilleurs outils proposent une procédure KYC (Know Your Customer) avec une vérification de l’identité via itsme ou l’eID.

Et si vous avez l’impression qu’il s’agit d’une étape supplémentaire, c’est en fait un avantage : en vérifiant votre identité, personne ne peut s’enregistrer à votre nom sur le réseau Peppol, ni envoyer de factures comme si elles venaient de vous. C’est une protection de plus contre le risque de fraude à la facture, qui est devenu réel depuis l’entrée en vigueur de la facturation électronique.

Conseil : découvrez ici comment vous enregistrer sur le réseau Peppol.

2. Existe-t-il une version gratuite ?

Être indépendant en Belgique implique des coûts (les frais d’inscription à la BCE, vos premières cotisations sociales…). Sans parler des impôts.

Heureusement, il existe également des logiciels de facturation électronique gratuits (ou des versions gratuites de logiciels payants) qui vous permettent d’envoyer et de recevoir des factures électroniques de manière illimitée.

3. Le logiciel propose-t-il d’autres fonctionnalités que la facturation ?

Certains outils vous permettent d’envoyer des factures électroniques via Peppol, et rien d’autre. Mais en tant qu’indépendant, vous avez également votre déclaration TVA, vos frais professionnels et bien sûr votre déclaration fiscale. Les logiciels qui intègrent tous ces aspects vous font gagner énormément de temps et vous évitent de souscrire des abonnements supplémentaires.

Les 7 meilleurs logiciels de facturation électronique pour les indépendants de Belgique

Pour vous éviter les recherches, voici un aperçu des 7 meilleurs outils de facturation électronique en Belgique.
Conseil : Consultez notre tableau comparatif pour voir en un clin d’œil quels outils disposent d’une version gratuite.

1. Accountable

Accountable est le meilleur choix pour les indépendants qui souhaitent une solution tout-en-un. En effet, le logiciel combine la facturation Peppol avec la comptabilité (gestion des entrées et des dépenses), les déclarations TVA, la déclaration fiscale, le listing client, les cotisations sociales et même un compte pro gratuit.

Pour qui : personnes physiques, indépendants à titre complémentaire, petites SRL et freelances.

Ce qui est inclus :

• Enregistrement gratuit sur Peppol et envoi et réception illimités de factures, même dans la version gratuite
• Établissement de factures électroniques en moins de deux minutes
• Calcul automatique de la TVA et établissement de la déclaration fiscale directement dans l’app
• Comptable IA pour répondre à vos questions sur votre situation fiscale, disponible 24 h/24 et 7 j/7
• Coachs fiscaux humains disponibles pour les abonnements payants
• Connexion avec le compte bancaire pour le traitement automatique des transactions ou ouverture d’un compte pro gratuit
• Assistance pour les personnes physiques et les petites sociétés

Prix : gratuit (Peppol illimité, frais professionnels et comptes bancaires limités), abonnements payants à partir de 1,50 €/mois pour les starters, 9,90 €/mois pour les autres indépendants.

Inconvénient : moins adapté si vous avez également besoin d’un CRM ou d’un outil de gestion de projet complet.

2. Billit

Billit est conçu pour l’échange et le traitement des factures, et s’intègre sans problème avec les logiciels comptables.

Pour qui : les entreprises orientées facturation, disposant de leur propre comptable

Ce qui est inclus :

• Bonne intégration Peppol, même pour les factures entrantes
• Intégration avec plusieurs banques belges
• Bonne intégration avec les logiciels comptables

Prix : par document (facture, note de crédit, reçu). Le prix peut grimper en cas de volume élevé. Estimez votre nombre de documents par mois avant d’y souscrire.

Inconvénient : pas d’établissement de la déclaration fiscale et pas d’assistance fiscale. En tant qu’indépendant, vous aurez besoin d’un outil ou d’un comptable en plus.

3. Teamleader (Focus ou One)

Teamleader Focus est un outil d’entreprise complet et compatible avec Peppol. Si vous gérez de nombreux clients et projets et que vous souhaitez convertir des devis en factures, cet outil est fait pour vous. Teamleader One est son petit frère, qui vous permet de créer des devis et des factures et de les envoyer via Peppol. 

Pour qui :

• Teamleader Focus : les petites PME qui souhaitent également gérer différents projets, clients et devis
• Teamleader One : les petits indépendants

Ce qui est inclus :

• CRM, gestion de projet, devis et facturation
• Peppol compris sans limite de documents
• + de 230 intégrations
• Teamleader One : version limitée

Prix : à partir de 99 €/an (Teamleader One), tarifs plus élevés pour la version Focus. Pas de version gratuite.

Inconvénient : fonctionnalités obsolètes pour le freelance ou l’indépendant en personne physique moyen qui n’a pas besoin de CRM. Pas d’assistance pour établir la déclaration TVA ou la déclaration fiscale en Belgique.

4. Dexxter

Dexxter est un logiciel comptable pour les personnes physiques qui veulent aussi envoyer et recevoir des factures électroniques via Peppol.

Pour qui : starters et indépendants à titre complémentaire (personnes physiques) qui souhaitent gérer eux-mêmes leur comptabilité.

Ce qui est inclus :

• Facturation électronique via Peppol (envoi et réception)
• Déclaration TVA et rappels de déclaration
• Module de comptabilité simple

Prix : abonnement payant, à partir de 180 €/an. Pas de version gratuite.

Inconvénient : ne convient pas pour les sociétés, peut devenir limité lorsque votre entreprise grandit.

5. Yuki

Yuki est avant tout une plateforme pour les bureaux de comptabilité. Si votre comptable travaille avec Yuki, c’est le choix logique pour optimiser votre collaboration. Yuki est compatible avec Peppol.

Pour qui : les entrepreneurs qui souhaitent tout confier à leur comptable.

Prix : abonnement, généralement via votre bureau de comptabilité.

Inconvénient : l’interface est datée et peu intuitive pour l’utiliser seul. Pas conçue pour les indépendants qui s’occupent eux-mêmes de leur comptabilité.

6. Onfact

Avec Onfact, vous créez rapidement des devis et des factures, et vous les envoyez via Peppol.

Pour qui : les indépendants qui souhaitent uniquement envoyer des factures, sans autres fonctionnalités.

Prix : abonnement payant, à partir de 15 €/mois.

Inconvénient : pas d’établissement de la déclaration TVA, pas de module de comptabilité et pas d’assistance fiscale. Il vous faut toujours un outil supplémentaire.

7. Lucy

Lucy est une plateforme belge 100 % axée sur la facturation électronique via Peppol. Vous recevez et envoyez vos factures, gérez une messagerie électronique et transférez vos documents à votre comptable ou votre logiciel de comptabilité.

Pour qui : les entrepreneurs qui travaillent avec un comptable et qui ont un outil de comptabilité séparé.

Ce qui est inclus :

• Envoi et réception illimités de factures Peppol
• Messagerie électronique pour tous les documents entrants
• Intégration avec les logiciels de comptabilité (p. ex. Yuki, Octopus, Exact Online)
• Vérification Peppol : détermine avant l’envoi si votre client est déjà enregistré

Prix : abonnement payant, de 4 €/mois à 15 €/mois, en fonction de vos besoins.

Inconvénient : pas d’établissement de la déclaration TVA, pas de suivi des frais professionnels et pas d’assistance fiscale. En tant qu’indépendant, vous aurez besoin d’un outil de comptabilité en plus.

Conclusion : quel outil choisir ?

Vous êtes indépendant ou vous avez une petite entreprise et vous souhaitez gérer (partiellement) votre comptabilité vous-même ? Accountable est la solution la plus complète. Pas seulement parce que Peppol y est totalement et gratuitement intégré, mais parce qu’elle vous permet également d’établir votre déclaration TVA et votre déclaration fiscale, mais aussi de suivre vos frais professionnels. Quatre fonctionnalités qui nécessiteraient quatre outils séparés.

Vous préférez travailler avec un bureau de comptabilité et vous assurer que vos factures sont correctes ? Privilégiez Billit ou Yuki.

Vous avez une PME avec plusieurs collaborateurs, projets et clients ? Teamleader Focus vous sera très utile, même s’il coûte plus cher et qu’il ne propose pas toutes les fonctionnalités en matière fiscale.

Questions fréquentes sur les logiciels de facturation électronique compatibles avec Peppol (FAQ)

Auteur - Valesca Wilms

Valesca est Content Manager chez Accountable Belgique. Elle écrit sur le statut de freelance, le travail indépendant et la fiscalité, en s'appuyant sur sa propre expérience de freelance.

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